Professionista dal 1990, è diventata la prima tennista del suo Paese a vincere un torneo WTA (Pattaya1991) . In costante progresso ha offerto le sue migliori prestazioni nel 1993 e nel 1994, biennio che l'ha vista vincere quattro titoli in singolare.
Fino al 1997 è rimasta tra le prime 30 a livello mondiale, e in quell'anno ha raggiunto i quarti di finale a Wimbledon, oltre che il suo miglior piazzamento nel ranking WTA (diciannovesima).
Più irregolare in seguito, ha dato alla luce un bambino nel settembre 1999, rientrando nel circuito l'anno successivo, ma da allora la sua attività di singolarista è cessata quasi del tutto. Ha continuato a lungo invece a giocare in doppio: l'ultima sua apparizione è stata nel gennaio 2010 agli Australian Open, dove ha affiancato la veterana giapponese Kimiko Date. Ha ufficializzato il ritiro nel 2013.
Durante la sua carriera, Yayuk Basuki ha vinto quindici titoli WTA, di cui sei come singolarista. Ha sconfitto spesso avversarie meglio quotate, tra cui Martina Hingis. Come singolarista ha anche preso parte a quattro Olimpiadi: Seul 1988, Barcellona 1992, Atlanta 1996 (dove è arrivata ai quarti di finale) e Sydney 2000.
Yayuk Basuki vive tuttora in Indonesia, dove commenta telecronache di tennis: è inoltre consulente presso il Ministero dello Sport.