De club werd in 1903 opgericht door studenten en behoort tot de oudste van het land. De club was er vanaf het eerste competitieseizoen in 1912 bij. In de beginjaren had de club nog concurrentie van AFK Union Žižkov, maar nadat deze in 1925 voor amateurstatus koos verdween de club in de anonimiteit. De club was vrij succesvol en werd kampioen in 1928, zes jaar later degradeerde de club naar de 2de klasse en kon na twee seizoenen terugkeren. Na de Tweede Wereldoorlog degradeerde de club in 1947. De club kon nooit terugkeren naar de hoogste klasse van Tsjechoslowakije en gleed weg naar de lagere klassen. In 1952 fusioneerde de club met Avia Čakovice en verdween zo van de voetbalkaart. Datzelfde jaar werd wel een opvolger opgericht TJ Slavoj Žižkov dat in 1965 de naam Viktoria aanpakte. Enkel in 1967 kwam de club dicht bij een promotie naar de eerste klasse.
Na de onafhankelijkheid van Tsjechië stond de club net zoals in 1912 aan de wieg van de nieuwe competitie. Tot 2003 was de club vrij succesvol en won twee bekers. Na een corruptieschandaal en slechte resultaten degradeerde de club in 2004 naar de tweede klasse waar de club tot 2007 speelde, toen werd de titel behaald en promoveerde de club terug. Na een nieuwe degradatie promoveerde de club opnieuw in 2011, om meteen weer te degraderen in het seizoen 2011-2012. In 2015 eindigde de club op een vierde plaats, maar kreeg geen licentie voor het volgende seizoen en degradeerde naar de derde klasse.