GPC5

GPC5
Ідентифікатори
Символи	GPC5, glypican 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602446 MGI: 1194894 HomoloGene: 3285 GeneCards: GPC5
Пов'язані генетичні захворювання
тетрада Фалло, ожиріння, нефротичний синдром, ВІЛ-заворювання, рак легень, розсіяний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • heparan sulfate proteoglycan binding Клітинна компонента • integral component of plasma membrane • extracellular region • мембрана • anchored component of membrane • Golgi lumen • клітинна мембрана • lysosomal lumen • міжклітинний простір • anchored component of plasma membrane • integral component of membrane • collagen-containing extracellular matrix • cell surface Біологічний процес • glycosaminoglycan biosynthetic process • retinoid metabolic process • glycosaminoglycan catabolic process • regulation of signal transduction • cell migration • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of protein localization to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2262	103978
Ensembl	ENSG00000179399	ENSMUSG00000022112
UniProt	P78333	Q8CAL5
RefSeq (мРНК)	NM_004466	NM_175500
RefSeq (білок)	NP_004457	NP_780709
Локус (UCSC)	Хр. 13: 91.4 – 92.87 Mb	Хр. 14: 115.33 – 116.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPC5 (англ. Glypican 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 572 амінокислот, а молекулярна маса — 63 707.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAQTWPVGF		RCLLLLALVG		SARSEGVQTC		EEVRKLFQWR		LLGAVRGLPD
SPRAGPDLQV		CISKKPTCCT		RKMEERYQIA		ARQDMQQFLQ		TSSSTLKFLI
SRNAAAFQET		LETLIKQAEN		YTSILFCSTY		RNMALEAAAS		VQEFFTDVGL
YLFGADVNPE		EFVNRFFDSL		FPLVYNHLIN		PGVTDSSLEY		SECIRMARRD
VSPFGNIPQR		VMGQMGRSLL		PSRTFLQALN		LGIEVINTTD		YLHFSKECSR
ALLKMQYCPH		CQGLALTKPC		MGYCLNVMRG		CLAHMAELNP		HWHAYIRSLE
ELSDAMHGTY		DIGHVLLNFH		LLVNDAVLQA		HLNGQKLLEQ		VNRICGRPVR
TPTQSPRCSF		DQSKEKHGMK		TTTRNSEETL		ANRRKEFINS		LRLYRSFYGG
LADQLCANEL		AAADGLPCWN		GEDIVKSYTQ		RVVGNGIKAQ		SGNPEVKVKG
IDPVINQIID		KLKHVVQLLQ		GRSPKPDKWE		LLQLGSGGGM		VEQVSGDCDD
EDGCGGSGSG		EVKRTLKITD		WMPDDMNFSD		VKQIHQTDTG		STLDTTGAGC
AVATESMTFT		LISVVMLLPG		IW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Saunders S., Paine-Saunders S., Lander A.D. (1997). Expression of the cell surface proteoglycan glypican-5 is developmentally regulated in kidney, limb, and brain. Dev. Biol. 190: 78—93. PMID 9331333 DOI:10.1006/dbio.1997.8690
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13