Idi na sadržaj

ACTB

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
ACTB
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3BYH, 3D2U, 3J82, 3LUE

Identifikatori
AliasiACTB
Vanjski ID-jeviOMIM: 102630 MGI: 87904 HomoloGene: 110648 GeneCards: ACTB
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za ACTB
Genomska lokacija za ACTB
Bend7p22.1Početak5,526,409 bp[1]
Kraj5,563,902 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za ACTB
Genomska lokacija za ACTB
Bend5 G2|5 81.8 cMPočetak142,888,870 bp[2]
Kraj142,892,509 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
nucleotide binding
nitric-oxide synthase binding
Tat protein binding
structural constituent of cytoskeleton
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
kinesin binding
vezivanje identičnih proteina
nucleosomal DNA binding
ATP binding
Ćelijska komponenta citoplazma
blood microparticle
membrana
focal adhesion
NuA4 histone acetyltransferase complex
ćelijska membrana
nukleoplazma
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Egzosom
citoskelet
dense body
cortical cytoskeleton
citosol
myelin sheath
Vanćelijsko
Biološki proces epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
substantia nigra development
Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
ephrin receptor signaling pathway
retina homeostasis
vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
platelet aggregation
cell junction assembly
cytoskeleton organization
protein deubiquitination
membrane organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001101

NM_007393

RefSeq (bjelančevina)

NP_001092

NP_031419

Lokacija (UCSC)Chr 7: 5.53 – 5.56 MbChr 5: 142.89 – 142.89 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Beta-aktin (skraćenica ljudskog gena i proteina ACTB/ACTB) jedna je od šest različitih aktinskih izoformi koje su identifikovane kod ljudi. Ovo je jedan od dva nemišićna citoskeletna aktina. Aktini su visoko konzervirani proteini[5][6] koji su uključeni u pokretljivost strukturu i integritet ćelija. Alfa aktini su glavni sastojak kontraktilnog aparata.[7]

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Dokazano je da beta-aktin imaju interakcije sa SPTBN2.[8][9] Pored toga, utvrđeno je da RNK-vezujući protein Sam68 komunicira s iRNK koja kodira β-aktin, koji regulira sinapsnu tvorbu dendritskih grana sa svojim citoskeletnim komponentama.

Pokazano je da beta-aktin aktivira eNOS, povećavajući time proizvodnju NO. Pokazalo se da ostatak od osam aminokiselina (326-333) u aktinu posreduje u interakciji između aktina i eNOS.[10]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Povratne mutacije u ovom genu povezane su sa slučajevima difuznim limfomom velikih ćelija.[11]

Primjena

[uredi | uredi izvor]

Beta aktin se često koristi u Western blotingu kao kontrola opterećenja, za normalizaciju ukupnih količina proteina i provjeru eventualne razgradnje proteina u uzorcima. Njegov transkript se također koristi se kao standard za održavanje stanja u qPCR. Njegova molekulska težina je približno 42 kDa.

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000075624 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029580 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (Jun 2015). "The evolution of compositionally and functionally distinct actin filaments". Journal of Cell Science. 128 (11): 2009–2019. doi:10.1242/jcs.165563. PMID 25788699.
  6. ^ Hanukoglu I, Tanese N, Fuchs E (Feb 1983). "Complementary DNA sequence of a human cytoplasmic actin. Interspecies divergence of 3' non-coding regions". Journal of Molecular Biology. 163 (4): 673–8. doi:10.1016/0022-2836(83)90117-1. PMID 6842590.
  7. ^ "Entrez Gene: ACTB actin, beta".
  8. ^ Mao B, Wu W, Li Y, Hoppe D, Stannek P, Glinka A, Niehrs C (maj 2001). "LDL-receptor-related protein 6 is a receptor for Dickkopf proteins". Nature. 411 (6835): 321–5. Bibcode:2001Natur.411..321M. doi:10.1038/35077108. PMID 11357136.
  9. ^ Holleran EA, Ligon LA, Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (Sep 2001). "beta III spectrin binds to the Arp1 subunit of dynactin". The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36598–605. doi:10.1074/jbc.M104838200. PMID 11461920.
  10. ^ Kondrikov D, Fonseca FV, Elms S, Fulton D, Black SM, Block ER, Su Y (Feb 2010). "Beta-actin association with endothelial nitric-oxide synthase modulates nitric oxide and superoxide generation from the enzyme". The Journal of Biological Chemistry. 285 (7): 4319–27. doi:10.1074/jbc.M109.063172. PMC 2836036. PMID 19946124.
  11. ^ Lohr JG, Stojanov P, Lawrence MS, Auclair D, Chapuy B, Sougnez C, Cruz-Gordillo P, Knoechel B, Asmann YW, Slager SL, Novak AJ, Dogan A, Ansell SM, Link BK, Zou L, Gould J, Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareño C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Hernández-Lemus E, Schwarz-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR (Mar 2012). "Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by whole-exome sequencing". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (10): 3879–84. Bibcode:2012PNAS..109.3879L. doi:10.1073/pnas.1121343109. PMC 3309757. PMID 22343534.

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]