Flotilje

En flotilje (spansk flotilla, «liten flåte») er en sjømilitær avdeling. Orlogsfartøyer av samme type samles administrativt i skvadroner, for eksempel torpedobåtskvadroner. Flere skvadroner samles i eskadrer. Flere eskadrer samles i flotiljer, som igjen samles i nummererte flåter, eller hele lands mariner.

I siste halvdel av det 19. århundre og første halvdel av det 20. var slagskip og kryssere organisert i eskadrer, mens mindre fartøy som destroyere og undervannsbåter var organisert i flotiljer.^{[trenger referanse]} Italias Regia Marina hadde for eksempel samlet sine torpedobåter i flere Flottiglia MAS (Motoscafo Armato Silurante).^{[trenger referanse]}

I Bundesmarine er flåten samlet i to Einsatzflottillen, som er inndelt i flere Geschwader (eskadrer). Flotiljene ledes av flotiljeadmiraler.^{[trenger referanse]}

Det danske Marinehjemmevernet er oppstilt i hjemmevernsflotiljer (HVF): 30 flotiljer bestående av et hjemmevernsfartøy med besetning, fem bevoktnings- og nærforsvarsflotiljer tilsvarende et kompani i Hæren, samt musikk- og stabsflotiljer.^{[trenger referanse]}