Bakker begon haar voetbalcarrière bij SV 't Harde. In 2007 ging ze daarnaast ook bij FC Twente in de jeugd voetballen. Doordeweeks trainde ze bij FC Twente en SV 't Harde. In het weekend speelde ze met 't Harde dan een wedstrijd in competitieverband en met FC Twente speelde ze af en toe een oefenwedstrijd.[1] In de zomer van 2008 verliet ze 't Harde om met de B3 van FC Twente in competitieverband te gaan spelen.
Op 28 maart 2009 maakte Bakker haar debuut voor FC Twente. In de tweede ronde van de KNVB beker speelde ze de gehele wedstrijd die met 2–0 gewonnen werd tegen HZVV.[2] In seizoen 2009/10 verovert Bakker een basisplaats in het elftal. Samen met Maud Roetgering vormt ze gedurende het seizoen het centrum van de verdediging. In seizoen 2010/11 verloor ze aanvankelijk haar basisplaats aan Larissa Wigger, maar na diens blessure werd er weer een beroep gedaan op Bakker. Op 12 mei 2011 veroverde ze de landstitel met de club. Doordat Wigger gedurende het seizoen 2011/12 grotendeels uitgeschakeld was, kreeg Bakker volop speeltijd. Totdat zij in de slotfase van de competitie zelf met een blessure te kampen kreeg. In 2015 nam ze afscheid van FC Twente.[3]
In 2010 werd Bakker door bondscoach Hesterine de Reus toegevoegd aan de EK-selectie van Oranje onder 19. Op het Europees kampioenschap in Macedonië speelde Bakker drie van de vier duels. Nederland werd uiteindelijk uitgeschakeld in de halve finales na strafschoppen.[5] Ze debuteerde op 24 mei 2010 voor Nederland –19 in een EK-wedstrijd tegen Frankrijk –17 (2 – 0).