MIPEP
| MIPEP | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | MIPEP | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 602241 MGI: 1917728 HomoloGene: 4337 GeneCards: MIPEP | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 13: 23.73 – 23.89 Mb | Chr 14: 61.02 – 61.14 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Mitohondrijska intermedijarna peptidaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MIPEP.[5]
Ovaj protein je kritična komponenta mehanizma za import ljudskih mitohondrijskih proteina uključenih u proces sazrijevanja jedarno kodiranih mitohondrijskih proteina, s mitohondrijskim translokacijskim peptidima, posebno onih proteina povezanih s OXPHOS-om.[6]
Struktura
[uredi | uredi izvor]Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 713 aminokiselina, a molekulska težina 80.641 Da[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLCVGRLGGL | GARAAALPPR | RAGRGSLEAG | IRARRVSTSW | SPVGAAFNVK | ||||
| PQGSRLDLFG | ERRGLFGVPE | LSAPEGFHIA | QEKALRKTEL | LVDRACSTPP | ||||
| GPQTVLIFDE | LSDSLCRVAD | LADFVKIAHP | EPAFREAAEE | ACRSIGTMVE | ||||
| KLNTNVDLYQ | SLQKLLADKK | LVDSLDPETR | RVAELFMFDF | EISGIHLDKE | ||||
| KRKRAVDLNV | KILDLSSTFL | MGTNFPNKIE | KHLLPEHIRR | NFTSAGDHII | ||||
| IDGLHAESPD | DLVREAAYKI | FLYPNAGQLK | CLEELLSSRD | LLAKLVGYST | ||||
| FSHRALQGTI | AKNPETVMQF | LEKLSDKLSE | RTLKDFEMIR | GMKMKLNPQN | ||||
| SEVMPWDPPY | YSGVIRAERY | NIEPSLYCPF | FSLGACMEGL | NILLNRLLGI | ||||
| SLYAEQPAKG | EVWSEDVRKL | AVVHESEGLL | GYIYCDFFQR | ADKPHQDCHF | ||||
| TIRGGRLKED | GDYQLPVVVL | MLNLPRSSRS | SPTLLTPSMM | ENLFHEMGHA | ||||
| MHSMLGRTRY | QHVTGTRCPT | DFAEVPSILM | EYFANDYRVV | NQFARHYQTG | ||||
| QPLPKNMVSR | LCESKKVCAA | ADMQLQVFYA | TLDQIYHGKH | PLRNSTTDIL | ||||
| KETQEKFYGL | PYVPNTAWQL | RFSHLVGYGA | RYYSYLMSRA | VASMVWKECF | ||||
| LQDPFNRAAG | ERYRREMLAH | GGGREPMLMV | EGMLQKCPSV | DDFVSALVSD | ||||
| LDLDFETFLM | DSE |
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Gen
[uredi | uredi izvor]Gen MIPEP kodira jednu metaloproteazu koja hidrolizira peptidni fragment od osam aminokiselina u dužini za obradu proteina usmjerenih na mitohondrije.[5] Ljudski gen MIPEP ima 21 egzon i nalazi se na hromozomskoj sekvenci 13q12. Pokazano je da je ljudski gen MIPEP visoko eksprimiran u srcu, skeletnim mišićima i gušterači, tri organska sistema koji se često prijavljuju sa poremećajima OXPHOS-a.
Protein
[uredi | uredi izvor]Ljudski protein mitohondrijska intermedijarna peptidaza, veličine je 80,6 kDa i sastoji se od 713 aminokiselina. Sadrži mitonhondrije koje ciljaju peptid (aminokiselina 1-35 peptidne sekvence). Zreli protein ima teorijski pI 6,03.[8]
Funkcija
[uredi | uredi izvor]Djelujući zajedno s općom mitohondrijskom procesnom peptidazom (MPP), MIPEP ima ključnu ulogu u sazrijevanju određene klase jedarno kodiranih proteinskih prekursora, koje karakterizira motiv, XRX (f) (F/L/I) XX (T/S /G) XXXX (f).[9] U početku, peptidaza MPP cijepa prekursore na pozicijama dvije peptidne veze iz R-ostatka, ostavljajući tipski oktapeptid na N-kraju proteina; nakon toga, MIP cijepa oktapeptid, dovršavajući konačno sazrijevanje prerađenog proteina.[10][11] Nedavno istraživanje pokazalo je da mitohondrijska intermedijarna peptidaza može razgraditi transmembranski receptor Notch na svom mjestu S5 i pomoći sazrijevanju notch proteina.[12]
Klinički značaj
[uredi | uredi izvor]U GWAS (eng. Genome-Wide Association Study) studiji kineske populacije, zabilježena je značajna povezanost između visoke miopije i varijante na sekvenci q12.12 hromosoma 13. Geni MIPEP i C1QTNF9B nalaze se u istom lokusu i izgledaju eksprimirani u mrežnjači i njenom pigmentnom epitelu (RPE) i stoga su vjerojatno povezani s visokom kratkovidnošću.[13] Međutim, funkcionalni dokazi koji povezuju MIPEP s kratkovidnošću tek trebaju biti pruženi.
Bialelne patogene varijante u MIPEP-u prisutne su u ranom dojenačkom uzrastu ili ranom djetinjstvu s hipotonijom (niskim mišićnim tonusom) i rijetkim tipom kardiomiopatije, koja se naziva nekompakcija lijeve komore. Mogu se vidjeti i katarakti. Kod četiri prijavljena pacijenta do sada je kardiomiopatija progresivna i rezultira smrću u prvih nekoliko godina života.[14]
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000027001 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021993 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b "Entrez Gene: MIPEP mitochondrial intermediate peptidase".
- ^ Chew A, Buck EA, Peretz S, Sirugo G, Rinaldo P, Isaya G (Mar 1997). "Cloning, expression, and chromosomal assignment of the human mitochondrial intermediate peptidase gene (MIPEP)". Genomics. 40 (3): 493–6. doi:10.1006/geno.1996.4586. PMID 9073519.
- ^ "UniProt, Q99797". Pristupljeno 11. 9. 2017.
- ^ "Uniprot: Q99797 - MIPEP_HUMAN".
- ^ Hendrick JP, Hodges PE, Rosenberg LE (Jun 1989). "Survey of amino-terminal proteolytic cleavage sites in mitochondrial precursor proteins: leader peptides cleaved by two matrix proteases share a three-amino acid motif". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 86 (11): 4056–60. doi:10.1073/pnas.86.11.4056. PMC 287387. PMID 2657736.
- ^ Isaya G, Kalousek F (1995). "Mitochondrial intermediate peptidase". Methods in Enzymology. 248: 556–67. doi:10.1016/0076-6879(95)48035-8. PMID 7674944.
- ^ Isaya G, Sakati WR, Rollins RA, Shen GP, Hanson LC, Ullrich RC, Novotny CP (Aug 1995). "Mammalian mitochondrial intermediate peptidase: structure/function analysis of a new homologue from Schizophyllum commune and relationship to thimet oligopeptidases". Genomics. 28 (3): 450–61. doi:10.1006/geno.1995.1174. PMID 7490080.
- ^ Lee SF, Srinivasan B, Sephton CF, Dries DR, Wang B, Yu C, Wang Y, Dewey CM, Shah S, Jiang J, Yu G (Aug 2011). "Gamma-secretase-regulated proteolysis of the Notch receptor by mitochondrial intermediate peptidase". The Journal of Biological Chemistry. 286 (31): 27447–53. doi:10.1074/jbc.M111.243154. PMC 3149338. PMID 21685396.
- ^ Shi Y, Qu J, Zhang D, Zhao P, Zhang Q, Tam PO, et al. (Jun 2011). "Genetic variants at 13q12.12 are associated with high myopia in the Han Chinese population". American Journal of Human Genetics. 88 (6): 805–13. doi:10.1016/j.ajhg.2011.04.022. PMC 3113245. PMID 21640322.
- ^ Eldomery MK, Akdemir ZC, Vögtle FN, Charng WL, Mulica P, Rosenfeld JA, et al. (2016). "MIPEP recessive variants cause a syndrome of left ventricular non-compaction, hypotonia, and infantile death". Genome Medicine. 8 (1): 106. doi:10.1186/s13073-016-0360-6. PMC 5088683. PMID 27799064.