SsDNA Viruso
Ekzemploj
[redakti | redakti fonton]- virusoj de bakterioj ("bakteriofagoj", ekz-e. Inoviridae, Microviridae),
- virusoj de mamuloj (Circoviridae, Parvoviridae),
- virusoj de birdoj (cirkovirus-tipaj organismoj),
- virusoj de plantoj (Geminiviridae, Nanovirusoj).
Ili povas havi
[redakti | redakti fonton]- liniajn unu-komponaĵ-genarojn (Parvoviridae),
- cirklajn unu-komponaĵ-genarojn (Microviridae, Inoviridae, Circoviridae, kelkaj Geminiviridae),
- cirklajn du-komponaĵ-genarojn (kelkaj Geminiviridae),
- cirklajn plur-komponaĵ- (>3) genarojn (Nanovirusoj).
Relativaj genaroj
[redakti | redakti fonton]- Circoviridae havas genaroj ĉirkaŭe 3 kb;
- Parvoviridae havas genarojn de 4-5 kb;
- Geminiviridae ĉirkaŭ 2.7 - 5.4 kb (depende ĉu estas mono/unu- aŭ bi/du-komponaĵo);
- Microviridae (inkluzive la fama fiX 174) ĉirkaŭ 4.5 kb;
- Inoviridae kaj la Nanovirusoj ĉirkaŭ 5-6 kb.
Replikiĝo postulas "replikiĝiva formo" (RF) duopa-ĉena DNA intermezaĵo/peraĵo: ĉi-tiu formiĝas frue post infekto, preskaŭ certe de la gastig-ĉelaj DNA polimerazoj prizorgemaj pri "riparo" de la ssDNA.
Rilate al la cirklaj genaroj en Eŭkariotoj (cirkovirusoj, ekz-e porka cirkoviruso; ankaŭ psitakino bek-kaj-plum-malsano agento, kok-infektiv-anemio agento; Geminiviridae; BBTRV), ĉi tiuj konvertiĝas al cccds-(plasmid-tipaj)-DNA en la nukleo, kaj asociiĝas al nucleaj proteinoj kaj compleksoj kiel la nukleosomoj.
Parvovirusoj havas interesan strategion por la replikiĝo de ties genaroj, helpe de interna- aŭ mem-complementareco de genar-ekstremaĵoj por konturi la problemon pri replikiĝo de liniaj DNA-genaroj. Virus-specifa procezo necesas por ambaŭ "nick" (pecet-) RF DNA, kaj por sekvestri freŝ-formitan genaran ssDNA por konstruantaj partikloj: rilate al la Parvoviridae la unua okazas helpe de proteino NS1 (kiu sinligas al la 5'-finaĵo produktita de la "pecetigo/nick") kaj la dua de la tavol-proteino; in Geminiviridae ŝajnas kvazaŭ la unua estus farita de simile-aganta proteino Rep, kaj la dua ankaŭ de la tavol-proteino.