Då 5. helikopterskvadronen (före detta 3. helikopterbataljon) avvecklas 2009 överförs helikopterverksamheten vid F 7 i Såtenäs till Tredje helikopterskvadronen.[1] Helikopterverksamheten vid F 7 i Såtenäs går tillbaka till tiden innan Helikopterflottiljen i och med att Flygvapnets FRÄD-grupp vid flygflottiljen har verkat där.
Tredje helikopterskvadronen är en av tre helikopterskvadroner ingående i Helikopterflottiljen och är med huvuddelen (inklusive skvadronsledning) samlokaliserad med Blekinge flygflottilj (F 17), men med en mindre enhet vid Skaraborgs flygflottilj (F 7). Skvadronen närhet till Flottans huvudbas i Karlskrona gör att förbandet ansvarar för Helikopterflottiljens sjöoperativ inriktning och var utrustad med Hkp 10 samt är utrustad med Hkp 15B (sjöoperativ inriktning).