ACAP1

ACAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JUE, 3T9K, 4CKG, 4CKH, 4F1P, 4NSW
Ідентифікатори
Символи	ACAP1, CENTB1, ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607763 MGI: 2388270 HomoloGene: 22835 GeneCards: ACAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • ендосома • recycling endosome membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9744	216859
Ensembl	ENSG00000072818 ENSG00000288169	ENSMUSG00000001588
UniProt	Q15027	Q8K2H4
RefSeq (мРНК)	NM_014716	NM_153788
RefSeq (білок)	NP_055531	NP_722483
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.34 – 7.35 Mb	Хр. 11: 69.77 – 69.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ACAP1 (англ. ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 81 536.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTVKLDFEEC		LKDSPRFRAS		IELVEAEVSE		LETRLEKLLK		LGTGLLESGR
HYLAASRAFV		VGICDLARLG		PPEPMMAECL		EKFTVSLNHK		LDSHAELLDA
TQHTLQQQIQ		TLVKEGLRGF		REARRDFWRG		AESLEAALTH		NAEVPRRRAQ
EAEEAGAALR		TARAGYRGRA		LDYALQINVI		EDKRKFDIME		FVLRLVEAQA
THFQQGHEEL		SRLSQYRKEL		GAQLHQLVLN		SAREKRDMEQ		RHVLLKQKEL
GGEEPEPSLR		EGPGGLVMEG		HLFKRASNAF		KTWSRRWFTI		QSNQLVYQKK
YKDPVTVVVD		DLRLCTVKLC		PDSERRFCFE		VVSTSKSCLL		QADSERLLQL
WVSAVQSSIA		SAFSQARLDD		SPRGPGQGSG		HLAIGSAATL		GSGGMARGRE
PGGVGHVVAQ		VQSVDGNAQC		CDCREPAPEW		ASINLGVTLC		IQCSGIHRSL
GVHFSKVRSL		TLDSWEPELV		KLMCELGNVI		INQIYEARVE		AMAVKKPGPS
CSRQEKEAWI		HAKYVEKKFL		TKLPEIRGRR		GGRGRPRGQP		PVPPKPSIRP
RPGSLRSKPE		PPSEDLGSLH		PGALLFRASG		HPPSLPTMAD		ALAHGADVNW
VNGGQDNATP		LIQATAANSL		LACEFLLQNG		ANVNQADSAG		RGPLHHATIL
GHTGLACLFL		KRGADLGARD		SEGRDPLTIA		METANADIVT		LLRLAKMREA
EAAQGQAGDE		TYLDIFRDFS		LMASDDPEKL		SRRSHDLHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhan X., Desiderio D.M. (2006). Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry. Anal. Biochem. 354: 279—289. PMID 16777052 DOI:10.1016/j.ab.2006.05.024
• Shinozaki-Narikawa N., Kodama T., Shibasaki Y. (2006). Cooperation of phosphoinositides and BAR domain proteins in endosomal tubulation. Traffic. 7: 1539—1550. PMID 17010122 DOI:10.1111/j.1600-0854.2006.00480.x
• Ma Z., Nie Z., Luo R., Casanova J.E., Ravichandran K.S. (2007). Regulation of Arf6 and ACAP1 signaling by the PTB-domain-containing adaptor protein GULP. Curr. Biol. 17: 722—727. PMID 17398097 DOI:10.1016/j.cub.2007.03.014

Див. також

• Хромосома 17