HCN1

HCN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3U0Z
Ідентифікатори
Символи	HCN1, BCNG-1, BCNG1, EIEE24, HAC-2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, GEFSP10, DEE24
Зовнішні ІД	OMIM: 602780 MGI: 1096392 HomoloGene: 32093 GeneCards: HCN1
Пов'язані генетичні захворювання
undetermined early-onset epileptic encephalopathy, generalized epilepsy with febrile seizures plus
Реагує на сполуку
івабрадин
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated sodium channel activity • ion channel activity • potassium channel activity • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated cation channel activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • аксон • мембрана • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • integral component of membrane • HCN channel complex • integral component of plasma membrane Біологічний процес • трансмембранний транспорт • retinal cone cell development • regulation of ion transmembrane transport • apical protein localization • ion transport • sodium ion transport • regulation of membrane potential • sodium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • potassium ion transport • protein homotetramerization • cellular response to cAMP Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	348980	15165
Ensembl	ENSG00000164588	ENSMUSG00000021730
UniProt	O60741	O88704
RefSeq (мРНК)	NM_021072	NM_010408
RefSeq (білок)	NP_066550	NP_034538
Локус (UCSC)	Хр. 5: 45.25 – 45.7 Mb	Хр. 13: 117.74 – 118.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HCN1 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 98 796.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGGGKPNSS		SNSRDDGNSV		FPAKASATGA		GPAAAEKRLG		TPPGGGGAGA
KEHGNSVCFK		VDGGGGGGGG		GGGGEEPAGG		FEDAEGPRRQ		YGFMQRQFTS
MLQPGVNKFS		LRMFGSQKAV		EKEQERVKTA		GFWIIHPYSD		FRFYWDLIML
IMMVGNLVII		PVGITFFTEQ		TTTPWIIFNV		ASDTVFLLDL		IMNFRTGTVN
EDSSEIILDP		KVIKMNYLKS		WFVVDFISSI		PVDYIFLIVE		KGMDSEVYKT
ARALRIVRFT		KILSLLRLLR		LSRLIRYIHQ		WEEIFHMTYD		LASAVVRIFN
LIGMMLLLCH		WDGCLQFLVP		LLQDFPPDCW		VSLNEMVNDS		WGKQYSYALF
KAMSHMLCIG		YGAQAPVSMS		DLWITMLSMI		VGATCYAMFV		GHATALIQSL
DSSRRQYQEK		YKQVEQYMSF		HKLPADMRQK		IHDYYEHRYQ		GKIFDEENIL
NELNDPLREE		IVNFNCRKLV		ATMPLFANAD		PNFVTAMLSK		LRFEVFQPGD
YIIREGAVGK		KMYFIQHGVA		GVITKSSKEM		KLTDGSYFGE		ICLLTKGRRT
ASVRADTYCR		LYSLSVDNFN		EVLEEYPMMR		RAFETVAIDR		LDRIGKKNSI
LLQKFQKDLN		TGVFNNQENE		ILKQIVKHDR		EMVQAIAPIN		YPQMTTLNST
SSTTTPTSRM		RTQSPPVYTA		TSLSHSNLHS		PSPSTQTPQP		SAILSPCSYT
TAVCSPPVQS		PLAARTFHYA		SPTASQLSLM		QQQPQQQVQQ		SQPPQTQPQQ
PSPQPQTPGS		STPKNEVHKS		TQALHNTNLT		REVRPLSASQ		PSLPHEVSTL
ISRPHPTVGE		SLASIPQPVT		AVPGTGLQAG		GRSTVPQRVT		LFRQMSSGAI
PPNRGVPPAP		PPPAAALPRE		SSSVLNTDPD		AEKPRFASNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Lee C.H., MacKinnon R. (2017). Structures of the human HCN1 hyperpolarization-activated channel. Cell. 168: 111—120. PMID 28086084 DOI:10.1016/j.cell.2016.12.023

Див. також

• Хромосома 5