NFYC

NFYC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N1J, 4AWL, 4CSR
Ідентифікатори
Символи	NFYC, CBF-C, CBFC, H1TF2A, HAP5, HSM, NF-YC, nuclear transcription factor Y subunit gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 605344 MGI: 107901 HomoloGene: 7440 GeneCards: NFYC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • CCAAT-binding factor complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • згортання білків • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4802	18046
Ensembl	ENSG00000066136	ENSMUSG00000032897
UniProt	Q13952	P70353
RefSeq (мРНК)	NM_001142587 NM_001142588 NM_001142589 NM_001142590 NM_001308114 NM_001308115 NM_014223	NM_001048168 NM_001277095 NM_008692 NM_001357192 NM_001357193 NM_001357194
RefSeq (білок)	NP_001136059 NP_001136060 NP_001136061 NP_001136062 NP_001295043 NP_001295044 NP_055038	NP_001041633 NP_001264024 NP_032718 NP_001344121 NP_001344122 NP_001344123
Локус (UCSC)	Хр. 1: 40.69 – 40.77 Mb	Хр. 4: 120.61 – 120.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFYC (англ. Nuclear transcription factor Y subunit gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTEGGFGGT		SSSDAQQSLQ		SFWPRVMEEI		RNLTVKDFRV		QELPLARIKK
IMKLDEDVKM		ISAEAPVLFA		KAAQIFITEL		TLRAWIHTED		NKRRTLQRND
IAMAITKFDQ		FDFLIDIVPR		DELKPPKRQE		EVRQSVTPAE		PVQYYFTLAQ
QPTAVQVQGQ		QQGQQTTSST		TTIQPGQIII		AQPQQGQTTP		VTMQVGEGQQ
VQIVQAQPQG		QAQQAQSGTG		QTMQVMQQII		TNTGEIQQIP		VQLNAGQLQY
IRLAQPVSGT		QVVQGQIQTL		ATNAQQGQRN		ASQGKPRRCL		KETLQITQTE
VQQGQQQFSQ		FTDGQRNSVQ		QARVSELTGE		AEPREVKATG		NSTPCTSSLP
TTHPPSHRAG		ASCVCCSQPQ		QSSTSPPPSD		ALQWVVVEVS		GTPNQLETHR
ELHAPLPGMT		SLSPLHPSQQ		LYQIQQVTMP		AGQDLAQPMF		IQSANQPSDG
QAPQVTGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nakshatri H., Bhat-Nakshatri P., Currie R.A. (1996). Subunit association and DNA binding activity of the heterotrimeric transcription factor NF-Y is regulated by cellular redox. J. Biol. Chem. 271: 28784—28791. PMID 8910521 DOI:10.1074/jbc.271.46.28784
• Dmitrenko V.V., Garifulin O.M., Kavsan V.M. (1997). Isolation and sequence analysis of the cDNA encoding subunit C of human CCAAT-binding transcription factor. Gene. 197: 161—163. PMID 9332362 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00255-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Romier C., Cocchiarella F., Mantovani R., Moras D. (2003). The NF-YB/NF-YC structure gives insight into DNA binding and transcription regulation by CCAAT factor NF-Y. J. Biol. Chem. 278: 1336—1345. PMID 12401788 DOI:10.1074/jbc.M209635200

Див. також

• Хромосома 1