Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBX21
Ідентифікатори
Символи
TBX21 , T-PET, T-bet, TBET, TBLYM, T-box 21, T-box transcription factor 21, IMD88
Зовнішні ІД
OMIM : 604895 MGI: 1888984 HomoloGene: 8353 GeneCards: TBX21
Пов'язані генетичні захворювання
aspirin-exacerbated respiratory disease [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• soma • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to organic substance • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • response to virus • T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lymphocyte migration • transcription, DNA-templated • regulation of immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of interleukin-2 production • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of T cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • negative regulation of T-helper 17 cell lineage commitment • negative regulation of T-helper 2 cell cytokine production • GO:1901313 positive regulation of gene expression
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 47.73 – 47.75 Mb
Хр. 11: 96.99 – 97.01 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
TBX21 (англ. T-box 21 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот , а молекулярна маса — 58 328[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGIVEPGCGD MLTGTEPMPG SDEGRAPGAD PQHRYFYPEP GAQDADERRG
GGSLGSPYPG GALVPAPPSR FLGAYAYPPR PQAAGFPGAG ESFPPPADAE
GYQPGEGYAA PDPRAGLYPG PREDYALPAG LEVSGKLRVA LNNHLLWSKF
NQHQTEMIIT KQGRRMFPFL SFTVAGLEPT SHYRMFVDVV LVDQHHWRYQ
SGKWVQCGKA EGSMPGNRLY VHPDSPNTGA HWMRQEVSFG KLKLTNNKGA
SNNVTQMIVL QSLHKYQPRL HIVEVNDGEP EAACNASNTH IFTFQETQFI
AVTAYQNAEI TQLKIDNNPF AKGFRENFES MYTSVDTSIP SPPGPNCQFL
GGDHYSPLLP NQYPVPSRFY PDLPGQAKDV VPQAYWLGAP RDHSYEAEFR
AVSMKPAFLP SAPGPTMSYY RGQEVLAPGA GWPVAPQYPP KMGPASWFRP
MRTLPMEPGP GGSEGRGPED QGPPLVWTEI APIRPESSDS GLGEGDSKRR
RVSPYPSSGD SSSPAGAPSP FDKEAEGQFY NYFPN
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші