ELK1

ELK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DUX
Ідентифікатори
Символи	ELK1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK1
Зовнішні ІД	OMIM: 311040 MGI: 101833 HomoloGene: 3832 GeneCards: ELK1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • axon terminus • нуклеоплазма • soma • дендрит (нейробіологія) • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to light stimulus • cellular response to testosterone stimulus • response to fibroblast growth factor • positive regulation of neuron death • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to gamma radiation • cellular response to lipid • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2002	13712
Ensembl	ENSG00000126767	ENSMUSG00000009406
UniProt	P19419	P41969
RefSeq (мРНК)	NM_005229 NM_001114123 NM_001257168	NM_007922
RefSeq (білок)	NP_001107595 NP_001244097 NP_005220	NP_031948
Локус (UCSC)	Хр. X: 47.64 – 47.65 Mb	Хр. X: 20.8 – 20.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ELK1 (англ. ELK1, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 44 888.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPSVTLWQF		LLQLLREQGN		GHIISWTSRD		GGEFKLVDAE		EVARLWGLRK
NKTNMNYDKL		SRALRYYYDK		NIIRKVSGQK		FVYKFVSYPE		VAGCSTEDCP
PQPEVSVTST		MPNVAPAAIH		AAPGDTVSGK		PGTPKGAGMA		GPGGLARSSR
NEYMRSGLYS		TFTIQSLQPQ		PPPHPRPAVV		LPSAAPAGAA		APPSGSRSTS
PSPLEACLEA		EEAGLPLQVI		LTPPEAPNLK		SEELNVEPGL		GRALPPEVKV
EGPKEELEVA		GERGFVPETT		KAEPEVPPQE		GVPARLPAVV		MDTAGQAGGH
AASSPEISQP		QKGRKPRDLE		LPLSPSLLGG		PGPERTPGSG		SGSGLQAPGP
ALTPSLLPTH		TLTPVLLTPS		SLPPSIHFWS		TLSPIAPRSP		AKLSFQFPSS
GSAQVHIPSI		SVDGLSTPVV		LSPGPQKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Harindranath N., Mills F.C., Mitchell M.P., Meindl A., Max E.E. (1998). The human elk-1 gene family: the functional gene and two processed pseudogenes embedded in the IgH locus. Gene. 221: 215—224. PMID 9795224 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00448-X
• Yamauchi T., Toko M., Suga M., Hatakeyama T., Isobe M. (1999). Structural organization of the human ELK1 gene and its processed pseudogene ELK2 genes. DNA Res. 6: 21—27. PMID 10231026 DOI:10.1093/dnares/6.1.21
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Janknecht R., Nordheim A. (1992). Elk-1 protein domains required for direct and SRF-assisted DNA-binding. Nucleic Acids Res. 20: 3317—3324. PMID 1630903 DOI:10.1093/nar/20.13.3317
• Enslen H., Tokumitsu H., Stork P.J., Davis R.J., Soderling T.R. (1996). Regulation of mitogen-activated protein kinases by a calcium/calmodulin-dependent protein kinase cascade. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 10803—10808. PMID 8855261 DOI:10.1073/pnas.93.20.10803
• Enslen H., Raingeaud J., Davis R.J. (1998). Selective activation of p38 mitogen-activated protein (MAP) kinase isoforms by the MAP kinase kinases MKK3 and MKK6. J. Biol. Chem. 273: 1741—1748. PMID 9430721 DOI:10.1074/jbc.273.3.1741

Див. також

• Хромосома X