ARID2

ARID2
Ідентифікатори
Символи	ARID2, BAF200, p200, AT-rich interaction domain 2, CSS6, SMARCF3
Зовнішні ІД	OMIM: 609539 MGI: 1924294 HomoloGene: 14601 GeneCards: ARID2
Пов'язані генетичні захворювання
Coffin-Siris syndrome 6, liver carcinoma
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинна мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • nucleosome disassembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell migration • negative regulation of cell population proliferation • heart morphogenesis • homeostatic process • embryonic organ development • cardiac muscle cell proliferation • coronary artery morphogenesis • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	196528	77044
Ensembl	ENSG00000189079	ENSMUSG00000033237
UniProt	Q68CP9	E9Q7E2
RefSeq (мРНК)	NM_152641 NM_001347839	NM_175251
RefSeq (білок)	NP_001334768 NP_689854	NP_780460
Локус (UCSC)	Хр. 12: 45.73 – 45.91 Mb	Хр. 15: 96.19 – 96.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARID2 (англ. AT-rich interaction domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 835 амінокислот, а молекулярна маса — 197 391.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANSTGKAPP		DERRKGLAFL		DELRQFHHSR		GSPFKKIPAV		GGKELDLHGL
YTRVTTLGGF		AKVSEKNQWG		EIVEEFNFPR		SCSNAAFALK		QYYLRYLEKY
EKVHHFGEDD		DEVPPGNPKP		QLPIGAIPSS		YNYQQHSVSD		YLRQSYGLSM
DFNSPNDYNK		LVLSLLSGLP		NEVDFAINVC		TLLSNESKHV		MQLEKDPKII
TLLLANAGVF		DDTLGSFSTV		FGEEWKEKTD		RDFVKFWKDI		VDDNEVRDLI
SDRNKSHEGT		SGEWIWESLF		HPPRKLGIND		IEGQRVLQIA		VILRNLSFEE
GNVKLLAANR		TCLRFLLLSA		HSHFISLRQL		GLDTLGNIAA		ELLLDPVDFK
TTHLMFHTVT		KCLMSRDRFL		KMRGMEILGN		LCKAEDNGVL		ICEYVDQDSY
REIICHLTLP		DVLLVISTLE		VLYMLTEMGD		VACTKIAKVE		KSIDMLVCLV
SMDIQMFGPD		ALAAVKLIEH		PSSSHQMLSE		IRPQAIEQVQ		TQTHVASAPA
SRAVVAQHVA		PPPGIVEIDS		EKFACQWLNA		HFEVNPDCSV		SRAEMYSEYL
STCSKLARGG		ILTSTGFYKC		LRTVFPNHTV		KRVEDSSSNG		QAHIHVVGVK
RRAIPLPIQM		YYQQQPVSTS		VVRVDSVPDV		SPAPSPAGIP		HGSQTIGNHF
QRTPVANQSS		NLTATQMSFP		VQGVHTVAQT		VSRIPQNPSP		HTHQQQNAPV
TVIQSKAPIP		CEVVKATVIQ		NSIPQTGVPV		SIAVGGGPPQ		SSVVQNHSTG
PQPVTVVNSQ		TLLHHPSVIP		QQSPLHTVVP		GQIPSGTPVT		VIQQAVPQSH
MFGRVQNIPA		CTSTVSQGQQ		LITTSPQPVQ		TSSQQTSAGS		QSQDTVIIAP
PQYVTTSASN		IVSATSVQNF		QVATGQMVTI		AGVPSPQASR		VGFQNIAPKP
LPSQQVSSTV		VQQPIQQPQQ		PTQQSVVIVS		QPAQQGQTYA		PAIHQIVLAN
PAALPAGQTV		QLTGQPNITP		SSSPSPVPAT		NNQVPTAMSS		SSTPQSQGPP
PTVSQMLSVK		RQQQQQHSPA		PPPQQVQVQV		QQPQQVQMQV		QPQQSNAGVG
QPASGESSLI		KQLLLPKRGP		STPGGKLILP		APQIPPPNNA		RAPSPQVVYQ
VASNQAAGFG		VQGQTPAQQL		LVGQQNVQLV		PSAMPPSGGV		QTVPISNLQI
LPGPLISNSP		ATIFQGTSGN		QVTITVVPNT		SFAPATVSQG		NATQLIAPAG
ITMSGTQTGV		GLPVQTLPAT		QASPAGQSSC		TTATPPFKGD		KIICQKEEEA
KEATGLHVHE		RKIEVMENPS		CRRGATNTSN		GDTKENEMHV		GSLLNGRKYS
DSSLPPSNSG		KIQSETNQCS		LISNGPSLEL		GENGASGKQN		SEQIDMQDIK
SDLRKPLVNG		ICDFDKGDGS		HLSKNIPNHK		TSNHVGNGEI		SPMEPQGTLD
ITQQDTAKGD		QLERISNGPV		LTLGGSSVSS		IQEASNAATQ		QFSGTDLLNG
PLASSLNSDV		PQQRPSVVVS		PHSTTSVIQG		HQIIAVPDSG		SKVSHSPALS
SDVRSTNGTA		ECKTVKRPAE		DTDRETVAGI		PNKVGVRIVT		ISDPNNAGCS
ATMVAVPAGA		DPSTVAKVAI		ESAVQQKQQH		PPTYVQNVVP		QNTPMPPSPA
VQVQGQPNSS		QPSPFSGSSQ		PGDPMRKPGQ		NFMCLWQSCK		KWFQTPSQVF
YHAATEHGGK		DVYPGQCLWE		GCEPFQRQRF		SFITHLQDKH		CSKDALLAGL
KQDEPGQAGS		QKSSTKQPTV		GGTSSTPRAQ		KAIVNHPSAA		LMALRRGSRN
LVFRDFTDEK		EGPITKHIRL		TAALILKNIG		KYSECGRRLL		KRHENNLSVL
AISNMEASST		LAKCLYELNF		TVQSKEQEKD		SEMLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhang X., Azhar G., Zhong Y., Wei J.Y. (2006). Zipzap/p200 is a novel zinc finger protein contributing to cardiac gene regulation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 794—801. PMID 16782067 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.211
• Patsialou A., Wilsker D., Moran E. (2005). DNA-binding properties of ARID family proteins. Nucleic Acids Res. 33: 66—80. PMID 15640446 DOI:10.1093/nar/gki145
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• Martens J.A., Winston F. (2003). Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI/SNF complexes. Curr. Opin. Genet. Dev. 13: 136—142. PMID 12672490 DOI:10.1016/S0959-437X(03)00022-4

Див. також

• Хромосома 12