Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MTF1
Ідентифікатори
Символи
MTF1 , MTF-1, ZRF, metal-regulatory transcription factor 1, metal regulatory transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 600172 MGI: 101786 HomoloGene: 4347 GeneCards: MTF1
Пов'язані генетичні захворювання
гіпотиреоз [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• response to cadmium ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to metal ion • GO:0001306 response to oxidative stress • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • central nervous system development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 37.81 – 37.86 Mb
Хр. 4: 124.7 – 124.74 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MTF1 (англ. Metal regulatory transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот , а молекулярна маса — 80 957[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGEHSPDNNI IYFEAEEDEL TPDDKMLRFV DKNGLVPSSS GTVYDRTTVL
IEQDPGTLED EDDDGQCGEH LPFLVGGEEG FHLIDHEAMS QGYVQHIISP
DQIHLTINPG STPMPRNIEG ATLTLQSECP ETKRKEVKRY QCTFEGCPRT
YSTAGNLRTH QKTHRGEYTF VCNQEGCGKA FLTSYSLRIH VRVHTKEKPF
ECDVQGCEKA FNTLYRLKAH QRLHTGKTFN CESEGCSKYF TTLSDLRKHI
RTHTGEKPFR CDHDGCGKAF AASHHLKTHV RTHTGERPFF CPSNGCEKTF
STQYSLKSHM KGHDNKGHSY NALPQHNGSE DTNHSLCLSD LSLLSTDSEL
RENSSTTQGQ DLSTISPAII FESMFQNSDD TAIQEDPQQT ASLTESFNGD
AESVSDVPPS TGNSASLSLP LVLQPGLSEP PQPLLPASAP SAPPPAPSLG
PGSQQAAFGN PPALLQPPEV PVPHSTQFAA NHQEFLPHPQ APQPIVPGLS
VVAGASASAA AVASAVAAPA PPQSTTEPLP AMVQTLPLGA NSVLTNNPTI
TITPTPNTAI LQSSLVMGEQ NLQWILNGAT SSPQNQEQIQ QASKVEKVFF
TTAVPVASSP GSSVQQIGLS VPVIIIKQEE ACQCQCACRD SAKERASSRR
KGCSSPPPPE PSPQAPDGPS LQLPAQTFSS APVPGSSSST LPSSCEQSRQ
AETPSDPQTE TLSAMDVSEF LSLQSLDTPS NLIPIEALLQ GEEEMGLTSS
FSK
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші